Läsperiod 4, 2004
Erik Fransén,
kursledare
Jeanette
Hellgren-Kotaleski
13x2
föreläsningstimmar, 5x4 laborationstimmar (eget labbande)
34 st, 11 kvinnor(K), 23 män(M).
Johnston D. and Wu S. M.-S.: Fundamentals of Cellular Neurophysiology, The MIT Press, ISBN 0-262-10053-3
Samt några utdrag
och tunna ”kompendier”:
Bower, J. M. and Beeman D.: The book of GENESIS, utdrag, Kapitel 2 and 5.
Sandberg, A.: Models of Development
Westermark, P.: Enzyme Kinetics and Biochemical Networks
DeSchutter, E.: Kap 10 Realistic modeling of small neuronal circuits ur boken Computational Neuroscience, CRC Press.
Bower and Bolouri: Kap 1 Modeling the activity of single genes, ur boken Computational modeling of genetic and biochemical networks, MIT Press.
TEN1 (4 p), LAB1
(1 p), PROJ1 (1p)
Examinationsgrad:
per 2004-06-28 har 14/34 studenter klarat hela kursen (41%).
Prestationsgraden är (14*4 + 29*1 + 28*1)/(34*6) = 55%.
lab1: 85% klara, 91%K, 83%M
proj1: 82% klara, 91%K, 78%M
ten1: 41% klara, 36%K, 43%M
Kursens mål är
att
• ge grundläggande kunskaper om matematisk modellering av
biologiska system och processer
för att
studenterna ska
• få kännedom om tillgängliga metoder inom området samt
en förståelse för de tekniska potentialerna och begränsningarna hos dessa.
Den största
förändringen har varit att labbarna redovisades under föreläsningstid.
Dessutom ändrades ordningen på vissa föreläsningar och visst material om gennätverk och neurala nätverk byttes ut.
Laboration 2 om
Jonrörelse, cellmembran och jonkanaler har förbättrats.
Sammanfattningvis
en ganska rolig och givande kurs att ge och att läsa (att döma av
studentresponsen).
Kursmaterialet är
stort och kursen blir ibland något av en ytlig genomgång av materialet snarare
än att studenterna verkligen får tränga in i det. Projektuppgiften var uppskattad.
Antalet studenter
som följer kursen är ökande.
Undervisningen
består i huvudsak av föreläsningar. Kursinnehållet och kursboken är tämligen
omfattande och även om ett urval görs blir det ganska lite om varje avsnitt.
Föreläsningarna har väl uppfattats som ganska givande även om mer fokusering
och tydlighet efterfrågas.
Laborationerna är
relativt väl tillrättalagda och kräver inte mer än ett par timmars
förberedelse. Laborationerna ger en god utdelning att döma av studenternas
kommentarer.
Projektuppgiften
görs under två veckor i slutet av kursen och innefattar typiskt
litteraturstudium kring ett visst modellerat system och muntlig (alt.
skriftlig) redovisning av detta.
Examinationen
består av skriftlig tentamen och 4 st laborationer. Tentamen är i huvudsak av
berättarkaraktär men med någon del där mera formella kunskaper testas. Det är
rimligt med hänsyn till hur kursen ser ut. För godkänd kurs skall också
projektuppgiften ha redovisats och godkänts.
Kursboken
(Johnston and Wu) är unik i sitt slag. Den upplevs som rätt så lättläst men
också omfattande och ganska pratig. Har dock fungerat ganska bra.
Kompendierna om Enzymkinetik och
biokemiska nätverk, om gennätverk och om neuronnätverk är viktiga. Övrigt material hade närmast orienterande karaktär.
Läsanvisningarna
tycks i huvudsak ha fungerat bra.
Utfördes elektroniskt med hjälp av ACE
efter tentan. 10/34 har svarat. Av detta framgår att:
- kursen upplevs som
meningsfull, intressant och ”forskningsnära”
- det var något mycket översiktsmaterial
- pedagogiken och
nivån på föreläsningarna är bra/acceptabel
- egna projekten
och redovisning av dem var ett trevligt och givande inslag
Inga särskilda
klagomål på för stor belastning har förekommit.
Kursen har som
förkunskapskrav 7E1200 Cell- och Molekylärbiologi och 7E1201 Neurovetenskap men
lästes i år av några studenter som inte hade detta fullt ut. Dessa hade också
större svårigheter än övriga. Med viss möda så går det dock uppenbarligen men
kursenkäten visar att studenterna upplevde sig inte ha riktigt tillräckliga
förkunskaper.
Kursens innehåll
följde i stort sett vad som planerats.
En länk till
denna kursanalys har lagts in på kursens aktuelltsida på WWW. Studentenkäten finns att läsa här.